Vasorin蛋白特異單鏈DNA適配體的篩選與鑒定
摘要:目的:篩選能特異識別vasorin(VASN)蛋白的單鏈DNA(ss DNA)適配體并對其進(jìn)行鑒定。方法:利用SPRSELEX技術(shù)篩選VASN蛋白特異ss DNA適配體,通過(guò)基因克隆測序、MEME在線(xiàn)軟件和RNA structure軟件分析富集文庫序列并挑選出候選適配體序列,利用EMSA、ELISA、流式細胞術(shù)對候選適配體進(jìn)行特異性與親和力鑒定。結果:經(jīng)過(guò)5輪SELEX篩選,獲得了與VASN蛋白特異結合的ss DNA適配體富集文庫,合成候選適配體,經(jīng)EMSA和ELISA檢測分析,證實(shí)適配體V4-2能與VASN蛋白特異結合,而不與無(wú)關(guān)對照牛血清白蛋白結合,其平衡解離常數為281.3±103.7 nmol/L;流式細胞術(shù)證實(shí)V4-2能夠特異識別高表達VASN蛋白的Hep G2細胞。結論:篩選獲得特異識別VASN蛋白的ss DNA適配體V4-2。
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