摘要：目的：利用生物信息學(xué)方法從EB病毒再激活的鼻咽癌細胞系基因表達譜中篩選差異表達基因,并分析它們之間的互相作用關(guān)系。方法：利用edg R包等相關(guān)軟件從基因表達譜中篩選差異表達的基因,分析它們之間的互相作用關(guān)系,并對其進(jìn)行在線(xiàn)GO分析、KEGG富集分析及蛋白互作分析。結果：共篩選出4496個(gè)差異表達基因,包括1954個(gè)上調基因和2542個(gè)下調基因。GO分析結果顯示,差異表達基因在生物過(guò)程（BP）中顯著(zhù)富集,包括病毒應答、Ⅰ型干擾素信號通路、γ干擾素介導的信號傳導途徑、病毒防御反應、膽固醇生物合成過(guò)程、氧化還原過(guò)程、類(lèi)異戊二烯生物合成過(guò)程、類(lèi)固醇代謝過(guò)程、脂質(zhì)代謝過(guò)程和花生四烯酸代謝過(guò)程;在分子功能（MF）中,包括絲氨酸型內肽酶活性、蛋白同二聚化活性、醛脫氫酶（NAD）活性、氧氣結合、3-氯烯丙基醛脫氫酶活性、血紅素結合、谷胱甘肽轉移酶活性、氧化還原酶活性、鐵離子結合和藥物結合;在細胞組分（CC）中,包括胞外體、細胞質(zhì)、細胞器膜、基底外側質(zhì)膜、胞外空間、內質(zhì)網(wǎng)膜、內質(zhì)網(wǎng)、過(guò)氧化物酶體、線(xiàn)粒體、頂端質(zhì)膜。KEGG通路分析顯示,差異表達基因在代謝途徑、抗生素生物合成、萜類(lèi)骨架生物合成、化學(xué)致癌作用、丙型肝炎、膽汁分泌、細胞色素P450代謝外源性物質(zhì)、氨基酸生物合成、類(lèi)固醇生物合成、精氨酸和脯氨酸代謝等信號通路中顯著(zhù)富集。在蛋白互作分析網(wǎng)絡(luò )中篩選出10個(gè)節點(diǎn)度最高的核心基因MAPK3、IRF7、IRF9、IFI6、TRIM22、IFI27、OAS2、TRIM31、HLA-F和MX1。結論：通過(guò)基因芯片對比篩選,EB病毒經(jīng)化學(xué)物質(zhì)再激活后引起宿主細胞多個(gè)基因表達發(fā)生變化,為相關(guān)臨床研究提供了重要的信息基礎。

注: 保護知識產(chǎn)權,如需閱讀全文請聯(lián)系生物技術(shù)通訊雜志社