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			加急見(jiàn)刊
		
        
		

		
		
        
			
        
				
				
				
        
					
					
        
						
						
        肺癌中SOX4基因的調控網(wǎng)絡(luò )分析驗證和蛋白質(zhì)預測
        
						
        李明陽(yáng); 馬春霞; 吳翰欣; 吳小海; 俞建昆  中國醫學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫學(xué)院醫學(xué)生物學(xué)研究所中心實(shí)驗室; 云南昆明650118; 昆明醫科大學(xué)附屬第二醫院; 云南昆明650118
        

					
        
					
        摘要：目的：分析SOX4基因的調控網(wǎng)絡(luò )和蛋白產(chǎn)物特征,并進(jìn)行驗證。方法：利用生物信息學(xué)方法預測人SOX4基因的調控網(wǎng)絡(luò )及其蛋白產(chǎn)物與其他蛋白的相互作用;在肺癌細胞系和肺癌臨床樣本中通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR對mi RNA-30s進(jìn)行定量分析。結果：人類(lèi)SOX4蛋白可能與TP53、DICER1和SDCBP2等3種蛋白相互作用;SOX4基因可能受多種lnc RNA和mi RNA的調控;hsa-mi R30s在臨床樣本中表達模式不完全相同。與癌旁組織相比,hsami R30c-5p和hsa-mi R30d-5p在癌組織中顯示低表達,hsa-mi R30d-5p則相反;與正常人胚肺成纖維細胞KMB17相比,肺癌細胞系A549和H1299中3個(gè)mi RNA-30成員的表達模式均為高表達。結論：SOX4基因及其蛋白產(chǎn)物的生物信息學(xué)分析為相關(guān)研究提供了重要信息基礎,但尚須相關(guān)實(shí)驗驗證,以確定相關(guān)性。
        
					
        注: 保護知識產(chǎn)權,如需閱讀全文請聯(lián)系生物技術(shù)通訊雜志社
        
				
        
				

			
        
		
        

		
		

	
        

	
	
	
	
	
	
	
	


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