摘要：對草魚(yú)生長(cháng)性狀進(jìn)行數量性狀基因座(quantitative trait locus,QTL)定位過(guò)程中,在15號連鎖群中定位到一個(gè)與體質(zhì)量相關(guān)的QTL,本研究根據已有的草魚(yú)遺傳連鎖圖譜和基因組序列,擬用短片段重復序列(short tandem repeat,STR)分型技術(shù)對該連鎖群的3個(gè)scaffolds中插入/缺失型突變位點(diǎn)進(jìn)行篩選,以降低分型成本,同時(shí)將篩選出的7個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)與草魚(yú)幼魚(yú)生長(cháng)性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。結果顯示,(1)草魚(yú)3個(gè)scaffolds中44個(gè)插入/缺失型突變位點(diǎn)中有17個(gè)簡(jiǎn)單重復序列(又稱(chēng)微衛星,simple sequence repeats,SSRs),2個(gè)位點(diǎn)引物設計不成功,設計的25對引物中僅22對擴增和分型成功;(2)22個(gè)位點(diǎn)中僅有7對引物在4個(gè)親本中存在多態(tài)性,直接測序結果發(fā)現,STR分型技術(shù)不僅可準確對插入/缺失型突變位點(diǎn)進(jìn)行分型,同時(shí)可降低分型成本;(3)將7個(gè)插入/缺失型突變位點(diǎn)與323尾選育F2草魚(yú)的生長(cháng)性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析發(fā)現,除了位點(diǎn)ID-10H和ID-41F以外,其余5個(gè)位點(diǎn)都與草魚(yú)幼魚(yú)的一個(gè)或多個(gè)生長(cháng)性狀顯著(zhù)相關(guān),其中ID-6H與幼魚(yú)肥滿(mǎn)度性狀顯著(zhù)相關(guān),位點(diǎn)ID-11F、ID-15F、ID-32F和ID-39F分別與草魚(yú)幼魚(yú)體質(zhì)量、體長(cháng)、體寬和體高性狀顯著(zhù)相關(guān),可將以上5個(gè)與草魚(yú)幼魚(yú)生長(cháng)性狀相關(guān)的突變位點(diǎn)用于草魚(yú)生長(cháng)性狀QTL加密和分子標記輔助育種。

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