PEG模擬干旱脅迫下野生大豆轉錄組分析
摘要:為研究耐旱型野生大豆在干旱脅迫下基因表達譜的變化,從備選野生大豆材料中篩選抗旱性強的野生大豆品種,同時(shí)探討最適PEG脅迫濃度,而后以野生大豆永46為試驗材料,利用RNA-seq技術(shù)對20%PEG6000處理不同時(shí)間的葉片進(jìn)行基因表達譜差異分析。結果顯示:獲得39 183個(gè)序列信息,其中各時(shí)期共有序列27 875個(gè)。隨干旱脅迫時(shí)間延長(cháng),差異表達基因數量發(fā)生變化,脅迫12 h達到最多。根據GO功能分析可將序列大致分為分子功能、細胞成分和生物學(xué)過(guò)程三大類(lèi),其差異表達基因廣泛涉及糖、脂類(lèi)、蛋白質(zhì)和核酸等生物大分子代謝、能量代謝以及次生代謝過(guò)程。在KEGG數據庫中,依據代謝途徑可將其定位在127個(gè)分支,包括植物-病原體互作、植物激素信號轉導、RNA降解、ABC轉運蛋白等,其中植物激素信號轉導途徑在不同時(shí)間處理下的變化都顯著(zhù)。轉錄因子分析發(fā)現在干旱脅迫下變化明顯的轉錄因子家族包括MYB、bHLH、AP2/EREBP、WRKY和NAC等。對4個(gè)不同功能基因干旱脅迫后不同時(shí)間的表達量進(jìn)行熒光定量分析,其變化趨勢與轉錄組數據相同。
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