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			加急見(jiàn)刊
		
        
		

		
		
        
			
        
				
				
				
        
					
					
        
						
						
        利用GBS技術(shù)開(kāi)發(fā)煙草SNP標記及遺傳多樣性分析
        
						
        蔡露; 楊歡; 王勇; 李廷軒; 陳光登  四川農業(yè)大學(xué)資源學(xué)院; 成都611130; 西昌學(xué)院農業(yè)科學(xué)學(xué)院; 四川西昌615000; 四川省煙草公司涼山州公司; 四川西昌615000
        

					
        
					
        摘要：研究煙草種質(zhì)資源的遺傳背景,為煙草種質(zhì)資源的高效利用提供依據。采用GBS(genotyping-by-sequencing)技術(shù),挖掘92份煙草種質(zhì)資源的SNP位點(diǎn),并進(jìn)行遺傳多樣性和遺傳結構分析。結果表明,測序共獲得了147.165 Gb數據,平均每個(gè)樣本1.599 Gb,篩選后共獲得93 685個(gè)高質(zhì)量的SNP位點(diǎn);不同地理來(lái)源煙草群體等位基因數(Na)為1.27~1.93,觀(guān)測雜合度(Ho)變化范圍為0.22~0.76,期望雜合度(He)為0.32~0.59,多態(tài)性位點(diǎn)數(PLN)范圍為15 877~44 249,多態(tài)性位點(diǎn)比率(PPL)為26.61%~74.17%,遺傳多樣性指數(H)為0.19~0.52,遺傳距離(GD)為?0.0148~0.3849?；谶z傳距離的NJ聚類(lèi)將材料劃分為兩個(gè)類(lèi)群;群體遺傳結構分析表明,本研究所用材料基于模型可劃分為4個(gè)亞群。通過(guò)GBS技術(shù)得到的測序數據量較大且質(zhì)量較高,群體多態(tài)性較高,整體遺傳多樣性偏低,群體結構劃分與種質(zhì)來(lái)源不完全相關(guān)。
        
					
        注: 保護知識產(chǎn)權,如需閱讀全文請聯(lián)系中國煙草科學(xué)雜志社
        
				
        
				

			
        
		
        

		
		

	
        

	
	
	
	
	
	
	
	


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