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      1. 加急見(jiàn)刊

        基于轉錄組數據的齒緣刺獵蝽微衛星分子標記開(kāi)發(fā)

        黎東海; 趙萍 廣東省生物資源應用研究所; 廣東省動(dòng)物保護與資源利用重點(diǎn)實(shí)驗室; 廣東省野生動(dòng)物保護和利用公共實(shí)驗室; 廣州510260; 凱里學(xué)院植物保護系; 貴州凱里556011

        摘要:【目的】齒緣刺獵蝽Sclomina erinacea是我國獵蝽科天敵昆蟲(chóng)常見(jiàn)種類(lèi),其不同地理種群存在明顯形態(tài)差異。本研究旨在利用已經(jīng)獲得的齒緣刺獵蝽轉錄組數據篩選微衛星位點(diǎn),為齒緣刺獵蝽種群遺傳多樣性和遺傳分化研究開(kāi)發(fā)可靠的微衛星分子標記?!痉椒ā炕诟咄繙y序技術(shù)平臺Illumina HiSeqTM 2000獲得齒緣刺獵蝽轉錄組數據(42 215條unigenes),利用MISA軟件進(jìn)行搜索發(fā)掘SSR標記;利用Primer Premier 3軟件設計SSR引物,從中隨機選取54對SSR引物,利用PCR技術(shù)在中國齒緣刺獵蝽9個(gè)地理種群上進(jìn)行驗證?!窘Y果】利用MISA軟件搜索到微衛星位點(diǎn)2 395個(gè),它們分布在2 107條unigenes上,其主要重復類(lèi)型是三核苷酸重復(占總SSR的44.43%),其次是二核苷酸重復(占總SSR的40.08%),再次是四核苷酸重復(占總SSR的12.94%)。利用Primer Premier 3軟件成功設計出2 000余對SSR引物。隨機選取的54對引物對9個(gè)齒緣刺獵蝽不同地理種群進(jìn)行的SSR位點(diǎn)PCR擴增結果表明,共有16對引物較好地擴增出目的片段?!窘Y論】研究表明利用齒緣刺獵蝽轉錄組數據可以大量發(fā)掘微衛星分子標記。本研究為進(jìn)一步開(kāi)展齒緣刺獵蝽的種群遺傳學(xué)研究奠定了基礎。

        注: 保護知識產(chǎn)權,如需閱讀全文請聯(lián)系昆蟲(chóng)學(xué)報雜志社

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