橄欖CaICE1基因的克隆和表達分析
摘要：為了解橄欖（Canarium album）抗寒相關(guān)轉錄因子 ICE1的調控功能,采用 RT-PCR 技術(shù)克隆了‘福欖 1 號’的 ICE1,命名為 CaICE1,并進(jìn)行生物信息學(xué)、qRT-PCR 表達模式和相關(guān) miRNA預測分析.結果表明,CaICE1 cDNA序列的開(kāi)放閱讀框長(cháng)度為 1 650 bp,可編碼549個(gè)氨基酸（GenBank登錄號 MG459422）.CaICE1 為不穩定親水性蛋白質(zhì),含有跨膜結構、磷酸化位點(diǎn)以及 HLH 保守結構域,定位于細胞核,與枳的 ICE1 親緣關(guān)系較近.CaICE1 密碼子偏好性較弱,AGA、AGG、TGG和 CCA可能為其最優(yōu)密碼子群.CaICE1 主要在橄欖花、種子和葉中大量表達,-3℃低溫脅迫下 CaICE1 表達水平比常溫顯著(zhù)上升. psRNAtarget 預測結果表明, CaICE1 可能是 miR825、 miR477、 miR5658、 miR1436 和miR394 等多個(gè)逆境響應 miRNA的靶基因.因此,CaICE1 可能在橄欖低溫脅迫過(guò)程中發(fā)揮重要調控作用,且可能受 miRNA的調控.
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