巨桉SuSy基因家族的生物信息學(xué)分析
摘要:為了解EgrSuSy 基因家族的生物學(xué)功能,從巨桉(Eucalyptus grandis)基因組數據庫中篩選出 18個(gè) SuSy 基因家族成員(EgrSuSy1-EgrSuSy18),采用生物信息學(xué)方法對其基因特征與表達模式進(jìn)行分析.結果表明,EgrSuSy 基因分布在 7 條染色體上,EgrSuSy 蛋白均定位在細胞質(zhì)膜上,EgrSuSy 家族成員均不具備信號肽.EgrSuSy 蛋白質(zhì)由 α-螺旋、延伸鏈、無(wú)規則卷曲、β-轉角組成.EgrSuSy蛋白與毛果楊(Populus trichocarpa)的 SuSy蛋白親緣關(guān)系相近.18 個(gè)EgrSuSy 基因在巨桉未成熟木質(zhì)部、成熟葉片、韌皮部、莖尖、木質(zhì)部以及幼葉組織中的表達模式不同.因此,EgrSuSy 在巨桉不同組織和發(fā)育時(shí)期的功能可能存在差異.
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