南移池塘養殖仿刺參腸道菌群結構分析
摘要:本文基于MiSeq高通量測序技術(shù)對南移福建池塘養殖仿刺參(Apostichopus japonicus)腸道菌落結構進(jìn)行分析。結果表明,仿刺參前腸(1 C_1)、中腸(1 C_2)和后腸(1C_3)測得的分類(lèi)操作單元(OTUs)分別為424、444和414;三組樣品的菌群物種豐度沒(méi)有較大差別,但優(yōu)勢菌種存在較大差異;優(yōu)勢菌群方面,后腸的優(yōu)勢菌群為Haliea屬和乳球菌屬(Lactococcus)(分別占后腸總菌數的11.97%和10.37%),而前腸和中腸的優(yōu)勢菌群均是乳球菌屬和芽孢桿菌屬(Bacillus),兩者在前腸菌落中的占比分別為27.91%和6.08%,在中腸中的占比分別為33.24%和6.97%。在重復性方面,三組樣品的菌落組成都有重疊,重疊率為74.35%,其中前腸與中腸相似度較高,菌株種類(lèi)有90%以上重疊。本文研究為仿刺參腸道益生菌的開(kāi)發(fā)利用提供基礎資料。
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