結核分枝桿菌Rv1860T細胞表位預測及分析
摘要:對結核分枝桿菌Rv1860的T細胞表位進(jìn)行預測及分析。從NCBI數據庫得到Rv1860的蛋白質(zhì)序列,運用Blastp分析Rv1860蛋白與人類(lèi)蛋白的同源性,NetMHCⅡ預測分析Rv1860的CD4+T細胞抗原表位,SYFPEITHI、NetMHC、BIMAS與IEDB預測分析Rv1860的CD8+T細胞抗原表位。結果表明,Rv1860的CD4+T細胞抗原表位有24條強結合肽段,117條弱結合肽段;CD8+T細胞抗原表位有3條結合性較強的肽段。綜合CD4+T細胞和CD8+T細胞抗原表位分析,得到1條優(yōu)勢抗原表位肽段為WLGTANNPV263—271,為進(jìn)一步臨床實(shí)驗和結核病診斷以及疫苗的設計打下基礎。
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