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			加急見(jiàn)刊
		
        
		

		
		
        
			
        
				
				
				
        
					
					
        
						
						
        向日葵Hsp70基因家族成員的全基因組鑒定與生物信息學(xué)分析
        
						
        逄洪波; 潘英杰; 李嘉琦; 李玥瑩; 金明; 高秋  沈陽(yáng)師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 沈陽(yáng)110034; 農業(yè)部全國草業(yè)產(chǎn)品質(zhì)量監督檢驗測試中心; 北京100125
        

					
        
					
        摘要：熱激蛋白70 (heat shock protein 70, Hsp70)是細胞應對高溫和其它逆境脅迫時(shí)所產(chǎn)生的一類(lèi)分子伴侶類(lèi)型應激蛋白。本研究以向日葵(Helianthus annuus)基因組數據庫為基礎,利用生物信息學(xué)方法對其Hsp70基因家族成員進(jìn)行鑒定和分析。結果表明,向日葵共有103個(gè)Hsp70基因家族成員,根據亞細胞定位結果可分為5種不同類(lèi)型,分析了不同成員編碼蛋白的理化性質(zhì)。系統進(jìn)化分析結果顯示,HaHsp70基因家族成員分為9個(gè)分支,每個(gè)分支成員的結構和功能相對保守。根據MEME軟件進(jìn)行保守基序分析,并鑒定了103個(gè)基因家族成員在向日葵17條染色體上的數量及分布情況,其中以15號染色體上分布最多,而11號染色體沒(méi)有成員分布。轉錄本結構分析展示了不同基因成員內含子以及外顯子的結構情況。本研究結果有助于了解向日葵Hsp70基因家族成員的情況,進(jìn)而為進(jìn)一步研究向日葵Hsp70基因家族成員的功能分析提供基礎。
        
					
        注: 保護知識產(chǎn)權,如需閱讀全文請聯(lián)系分子植物育種雜志社
        
				
        
				

			
        
		
        

		
		

	
        

	
	
	
	
	
	
	
	


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