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			加急見(jiàn)刊
		
        
		

		
		
        
			
        
				
				
				
        
					
					
        
						
						
        小麥SBP基因家族生物信息學(xué)分析
        
						
        呂亮杰; 陳希勇; 胡夢(mèng)蕓; 劉玉平; 孫麗靜; 馬樂(lè ); 李輝  河北省農林科學(xué)院糧油作物研究所、河北省作物遺傳育種實(shí)驗室; 河北石家莊050035
        

					
        
					
        摘要：SBP基因家族是植物所特有的一類(lèi)重要轉錄因子,含79個(gè)氨基酸殘基保守結構域,主要參與植物生長(cháng)發(fā)育、生理生化過(guò)程。為進(jìn)一步探討小麥SBP基因家族的基因功能,通過(guò)比對小麥最新基因組數據,結合公布的Chinese Spring的基因組數據,采用生物信息學(xué)方法對其基因結構、染色體分布、蛋白保守結構域、系統進(jìn)化樹(shù)及表達譜進(jìn)行分析。結果獲得了50個(gè)SBP基因,命名為T(mén)aSBPs,根據染色體編號排列為T(mén)aSBP1~TaSBP50。結果表明,50個(gè)小麥TaSBP基因分布于除4B、4D染色體外的其余19條染色體上,編碼192~1104個(gè)氨基酸,基因外顯子數量2~11個(gè)變化不等;串聯(lián)重復和片段復制是小麥SBP家族基因擴張的主要模式;7種作物SBP基因的系統進(jìn)化樹(shù)可分為4個(gè)類(lèi)別,同一類(lèi)之間的結構較為相似;小麥50個(gè)TaSBP基因家族含有10個(gè)motif,推測小麥TaSBP基因家族應都含有motif1、motif2、motif4。50個(gè)TaSBP基因都在13個(gè)組織器官中檢測到轉錄本,不同組織器官中TaSBP基因的表達存在明顯的差異。
        
					
        注: 保護知識產(chǎn)權,如需閱讀全文請聯(lián)系華北農學(xué)報雜志社
        
				
        
				

			
        
		
        

		
		

	
        

	
	
	
	
	
	
	
	


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