內蒙古自治區PRRSV分離株全基因測序與遺傳變異分析
摘要:目的從內蒙古自治區某豬場(chǎng)疑似豬繁殖與呼吸綜合征(PRRS)病料中分離PRRSV,進(jìn)行毒株的遺傳變異情況及分子生物學(xué)特征分析。方法從PRRS疑似病料中用Marc145細胞分離PRRSV,設計引物,PCR擴增其全基因序列并利用MEGAFO進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析。結果成功分離到一株P(guān)RRSV,該毒株可在Marc145細胞上增殖并產(chǎn)生細胞病變,免疫熒光檢測到特異性熒光,將其命名為NM-12株。全基因序列及Nsp2核苷酸序列分析表明,該毒株屬于美洲型,與Hanvet1.vn及GX1003等毒株處于同一分支。Nsp2氨基酸序列分析顯示,該分離株具有與高致病性PRRSV一致的30個(gè)氨基酸缺失。ORF5基因序列分析顯示,NM12與JXA1親緣關(guān)系較近,但處于不同的分支。結論成功分離到1株P(guān)RRSV,屬于美洲型,可為分析內蒙古自治區PRRSV遺傳進(jìn)化趨勢及防控提供理論參考。
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