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			加急見(jiàn)刊
		
        
		

		
		
        
			
        
				
				
				
        
					
					
        
						
						
        可視化膜芯片技術(shù)用于結核分枝桿菌基因分型的研究
        
						
        王少華; 楊衛紅; 鄭丹薇; 朱巖昆; 馬曉光; 石潔; 李輝; 張國龍  河南省疾病預防控制中心結核病參比實(shí)驗室; 河南鄭州450016; 江蘇獵陣生物科技有限公司
        

					
        
					
        摘要：目的建立用于結核分枝桿菌間隔區寡核苷酸分型的膜芯片技術(shù),并評估其應用價(jià)值。方法根據結核分枝桿菌直接重復序列43間隔子設計特異的分型探針并制作膜芯片,通過(guò)直接重復序列特異引物擴增基因組間隔子相應區段的DNA。擴增引物用生物素標記,擴增標記后的產(chǎn)物與芯片的探針雜交,根據顯色后產(chǎn)生的斑點(diǎn)確定標本的基因亞型。對175株臨床分離菌株用該方法進(jìn)行分型,用傳統膜雜交法作對照。結果H37Rv和BCG菌株DNA擴增產(chǎn)物與膜芯片雜交,43條探針均出現雜交斑點(diǎn)。用膜芯片技術(shù)雜交獲得H37Rv和BCG菌株的基因亞型,與傳統固相膜雜交結果一致。用該法對175株臨床分離菌株進(jìn)行分型,其中167株屬于4個(gè)已知的基因家族,最大的一個(gè)為北京家族,占62.9%(110/175)。北京家族中有107株為典型北京家族(1-34間隔區缺失),3株為北京樣基因型(Beijing-like),即非典型北京家族(35-43間隔區也有缺失)。T家族占30.9%(54/175),包括34株T1,14株T2,6株T3。2株Manu2和1株LAM9;未匹配8株,占4.6%(8/175)。膜芯片技術(shù)雜交結果與傳統膜雜交結果完全相同,耗時(shí)由膜雜交法的195 min縮短為22 min。方法的靈敏度為10個(gè)MTB/ml。結論膜芯片技術(shù)用于結核分枝桿菌間隔區寡核苷酸基因分型靈敏度高且簡(jiǎn)便易行,適用于臨床流行病學(xué)追蹤與分析。
        
					
        注: 保護知識產(chǎn)權,如需閱讀全文請聯(lián)系中國病原生物學(xué)雜志社
        
				
        
				

			
        
		
        

		
		

	
        

	
	
	
	
	
	
	
	


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