白羽王鴿卵清蛋白關(guān)聯(lián)蛋白Y基因(OVALY)克隆與生物信息學(xué)分析
摘要:旨在獲得白羽王鴿(Columba livia)卵清蛋白關(guān)聯(lián)蛋白Y基因(OVALY)的cDNA序列,并進(jìn)行生物信息分析。研究結果顯示:OVALY基因cDNA全長(cháng)為2068bp,其中5′非編碼區序列180bp,3′非編碼區序列720bp,開(kāi)放閱讀框1164bp,編碼的蛋白分子量約44.19ku,含氨基酸殘基388個(gè)(GenBank∶KX230792);與NCBI數據庫中朱鹮(Nipponianippon)OVALY基因序列同源性最高(81%),與白尾鷹(Haliaeetusalbicilla)和沙雞(Pteroclesgutturalis)OVALY基因序列的同源性分別為80%和79%。經(jīng)潛在糖基化位點(diǎn)和磷酸化位點(diǎn)預測分析發(fā)現,OVALY蛋白結構中潛在糖基化位點(diǎn)和磷酸化位點(diǎn)分別為4個(gè)和22個(gè);經(jīng)CDD(conserved domaindatabase)數據庫分析發(fā)現,OVALY蛋白具有絲氨酸蛋白酶抑制劑家族的反應中心區域,屬于絲氨酸蛋白酶抑制劑超家族。
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