不同擴增方法和探針長(cháng)度對植入前單個(gè)卵裂球比較基因組雜交檢測結果的影響
摘要:目的 探討不同擴增方法和探針長(cháng)度對植入前單個(gè)卵裂球比較基因組雜交(comparativegenomic hybridization,CGH)檢測結果的影響,為植入前產(chǎn)前診斷奠定基礎。方法隨機將20枚植入前6~8細胞期胚胎卵裂球分為A和B組(各10枚),取1名正常男性外周血20枚淋巴細胞,分為C和D組(各10枚)作為對照。A和c組經(jīng)簡(jiǎn)并寡聚核苷酸聚合酶鏈反應(degenerate oligonueleotide primedpolymerase chainreaction,DOPPCR)、B和D組經(jīng)多重置換擴增(multiple displacement amplification,MDA)分別進(jìn)行全基因組擴增(wholegenomeamplification,WGA),用上述全基因組擴增產(chǎn)物進(jìn)行PCR擴增TBX1基因2號外顯子,驗證其特異性。將獲得的WGA產(chǎn)物制備成250~750bp和750~2000bp2種不同長(cháng)度的探針與正常男性中期染色體核型進(jìn)行雜交,Y染色體性別決定區(sex—determiningregionofY,SRY)基因驗證CGH檢測結果。結果(1)用DOP—PCR擴增時(shí),A組10枚卵裂球中有9枚WGA成功,C組10枚淋巴細胞WGA均成功;但其擴增產(chǎn)物進(jìn)一步擴增TBX1基因2號外顯子時(shí),出現較多非特異性條帶。CGH檢測中,5例卵裂球用長(cháng)度250~750bp的探針檢測時(shí),1例失敗,1例CGH軟件核型分析結果與SRY結果不一致。(2)經(jīng)MDA的B和D組,均WGA成功;其產(chǎn)物進(jìn)一步擴增TBX1基因2號外顯子時(shí),非特異性條帶少。CGH檢測中,探針長(cháng)度為250~750bp的5例卵裂球均檢測成功,且與SRY驗證結果一致。(3)用長(cháng)度為750~2000bp探針檢測時(shí),雜交效果不好。結論單卵裂球全基因組擴增,MDA較DOPPcR方法穩定,特異性強,CGH檢測中,擴增產(chǎn)物酶切至250~750bp制備的探針雜交圖像均勻、清晰,軟件分析核型結果穩定、準確。
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